Summa sidvisningar

måndag 28 december 2009

YERSINIA kannat

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/lproks.cgi
YERSINIA
Genus Yersinia
Genus Yersinia käsittää 14 lajia, joista Y. pestis, Y. pseudotuberculosis ja Y. enterocolitica ovat ihmispatogeenejä. Genomiset sekvenssit on tehty seitsemästä Y.pestislajista, neljästä Y-pseudotuberculosis-lajista ja Y-enterocolitica-kannasta serotyypistä O:8 strain.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/lproks.cgi

Neljästätoista Y-pestis-kannasta on meneillään sekvenssianalyysit: Lisäksi useista muista kannoista: Y. aldovae, Y. bercovieri, Y. frederikseni, Y. intermedia, Y. mollareti, Y. ruckeri ja Y. rohdei.

Tools legend: T –
TaxMap; P –
ProtTable; C –
COG Table; D –
3-D neighbors; L –
BLAST; S –
CDD search; G –
GenePlot; X –
TaxPlot; M - gMap; F –
FTP; R –
Publications. * size is estimated, otherwise genome size is calculated based on existing sequences

190 Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 B Gammaproteobacteria 4.67 47.2 1 1 AM286415.1 NC_008800.1 01/12/07 11/12/09 Welcome Trust Sanger Institute T P D L S G X M F R

16067 Yersinia pestis Angola B Gammaproteobacteria 4.68 47.6 1 2 CP000901.1 NC_010159.1 12/12/07 05/01/09 TIGR T P D L S G X M F

16645 Yersinia pestis Antiqua B Gammaproteobacteria 4.88 47.7 1 3 CP000308.1 NC_008150.1 06/09/06 11/12/09 DOE Joint Genome Institute T P D L S G X M F R

34 Yersinia pestis CO92 B Gammaproteobacteria * 4.88 47.6 1 3 AL590842.1 NC_003143.1 10/05/01 05/06/09 Welcome Trust Sanger Institute T P C D L S G X M F R

288 Yersinia pestis KIM 10 B Gammaproteobacteria 4.7 47.7 1 1 AE009952.1 NC_004088.1 07/27/02 11/10/09 University of Wisconsin-Madison, USA [more] T P C D L S G X M F R

16646 Yersinia pestis Nepal516 B Gammaproteobacteria * 4.61 47.6 1 2 CP000305.1 NC_008149.1 06/09/06 05/06/09 DOE Joint Genome Institute T P D L S G X M F R

16700 Yersinia pestis Pestoides F B Gammaproteobacteria 4.71 47.7 1 2 CP000668.1 NC_009381.1 04/13/07 04/29/09 DOE Joint Genome Institute T P D L S G X M F

10638 Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 B Gammaproteobacteria 4.81 47.7 1 4 AE017042.1 NC_005810.1 06/04/04 05/01/09 Academy of Military Medical Sciences, The Institute of Microbiology and Epidemiology, China T P C D L S G X M F R

16070 Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 B Gammaproteobacteria * 4.91 47.2 1 2 CP000720.1 NC_009708.1 07/23/07 11/12/09 TIGR T P D L S G X M F R

12950 Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 B Gammaproteobacteria * 4.8 47.6 1 2 BX936398.1 NC_006155.1 09/11/04 05/01/09 Lawrence Livermore National Laboratory [more] T P C D L S G X M F R

28745 Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ B Gammaproteobacteria 4.77 47.5 1 1 CP001048.1 NC_010634.1 04/25/08 05/07/09 DOE Joint Genome Institute [more] T P D L S G X M F

28743 Yersinia pseudotuberculosis YPIII B Gammaproteobacteria 4.7 47.5 1 CP000950.1 NC_010465.1 03/11/08 05/07/09 DOE Joint Genome Institute [more] T P D L S G X M F

TAUTI RUTTO ja YERSINIOOSI

Y.pestis aiheuttaa ruttoa ( bubonic plague) ja Y. pseudotuberculosis sekä Y. enterocolitica
aiheuttavat useimmin elintarvikkeistä aiheutuvaa yersinioosia (yersiniosis), mikä on tavallisesti diarrheatauti ja joskus siitä seuraa postinfektiöösi reaktiivinen artriitti.

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar