Summa sidvisningar

söndag 27 december 2009

Yersinioiten erottamisesta toisistaan

LÄHDE: Tan Y, Wu M et al. Cellular fatty acids as chemical markers for differentiation of Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis. Lett Appl Microbiol. 2010 Jan;50(1):104-11. Laboratory of Analytical Microbiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing, China.

Tämän artikkelin työntarkoitus: Yhteensä 141 eri Yersinia-pestis isolaattia eri tautifokuksista Kiinassa tutkittiin niiden solurasvahappokompositioitten selvittämiseksi. Myös 20 kpl eri Yersinia pseudotuberculosis-kantaa tutkittiin myös kaasukromatografiamenetelmin.

Metodit ja tulokset.
Kokonaisten solujen rasvahappojen metyyliestereitä ( FAMEs) saatiin tutkittua saponifikaatiolla, metylaatiolla ja uutolla ja sitten analysoitiin käyttämällä MIS standardia (standardized Microbial Identification System):
Y. pestis ja Y. pseudotuberculosis-kannat olivat aika samanlaisia mitä tulee pääasiallisimpaan CFA profiiliin, johon kuuluvat seuraavat rasvahapot: C16:0, C17:0 cyclo, 3-OH-C14:0, C16:1 omega 7c ja C18:1 omega 7c näitä oli yli 80% kaiksita rasvahapoista.

Yhteenveto:
Yersinia pestis pystyttiin helposti erottamaan Y.psewudotuberkulosiksesta, kun tarkattiin eräitten CFA rasvahappoparien suhteita,
esim.
14:0/18:0 versus 18:1 omega 7c/18:0,
3-OH-14:0/18:0 versus 18:1 omega 7c/18:0,
16:1 omega 7c/18:0 versus 18:1 omega 7c/18:0,
12:0/18:0 versus 18:1 omega 7c/18:0
ja 12:0 ALDE/18:0 versus 16:1 omega 7c/18:0 fatty acids.

Mikä merkitys tällä tutkimuksella on?
Nykyisessä tutkimuksessa käytettiin normalisoituja Sherlock MIS ja Sherlock satndard kirjastoja analysoitaessa rasvahappokompositioita Y. pestiksen ja Y. pseudotuberkulosiksen eri kannoista. Näitä kahta toisiaan lähellä olevaa kantaa erottamaan havaittiin toimivan tiettyjen CFA komponenttien suhteet kemiallisten merkkien tapaan. Niitä kantoja on vaikea erottaa yksinkertaisesti vain vertailemalla CFA-profiileja, mikä perustuu muihin tutkimuksiin.
http://www.rkm.com.au/BACTERIA/Yersinia-pestis.html

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar