Summa sidvisningar

måndag 5 juni 2023

TUBERKULOOSI on maailmassa tavallinen tauti. Katala miliaaritubi.

 https://www.duodecimlehti.fi/duo15036#top-wrapper

 

Korvatulehdus miliaarituberkuloosin harvinaisena ilmentymänä ja paradoksaalisen reaktion aiheuttama mahalaukun haavauma kuolinsyynä

2019;135(15):1403-7

Jouni Hedman, Ekaterina Musatova ja Tuula Vasankari

Tuberkuloosi on edelleen maailman tappavin infektiotauti. Joka kolmannen maapallon asukkaan arvellaan olevan Mycobacterium tuberculosis -bakteerin infektoima. Suomessa todetaan nykyisin noin 250 uutta tapausta vuodessa, ja noin 30 % tapauksista on keuhkojen ulkopuolisia tautimuotoja. Korvatuberkuloosi on erittäin harvinainen tauti. Kuvaamme miliaarituberkuloositapauksen, jossa potilaalla oli myös ulko- ja välikorvatulehdus. Asianmukaisesta lääkehoidosta huolimatta potilas menehtyi mahahaavaan, jonka kudosnäytteen histologisesta löydöksestä diagnosoitiin tuberkuloosi.

Tuberculosis of the ear as a rare manifestation of miliary tuberculosis and a fatal perforated stomach ulcer due to paradoxal reaction

Tuberculosis remains the deadliest infection in the world. Every third human is infected by Mycobacterium tuberculosis (LTBI). In Finland nowadays about 250 new cases are diagnosed each year, about 30% of them being extrapulmonary tuberculosis. Tuberculosis of the ear is an extremely rare disease. We present a patient case with miliary tuberculosis involving a manifestation of external and media otitis. In spite of adequate tuberculosis treatment with a 4-drug regimen, the patient died because of a perforated stomach ulcer, in which the histological examination was diagnostic for tuberculosis.

Ehkäisevästä toiminnasta, diagnostiikasta ja hoidosta huolimatta tuberkuloosi on edelleen tärkeä globaali terveysongelma. Vuodesta 2000 alkaen on onnistuttu estämään noin 54 miljoonaa tuberkuloosikuolemaa, mutta tuberkuloosi on edelleen tappavin infektiotauti maailmassa (1). Tuberkuloosikuolemien määräksi on arvioitu enintään kolme miljoonaa vuodessa. Vuonna 2017 tautiin tiedetään kuolleen 1,6 miljoonaa ihmistä, joista 300 000 oli HIV-positiivisia. Kymmenen miljoonaa ihmistä sairastuu maailmassa vuosittain tuberkuloosiin (1).

Maailman väestöstä jopa joka kolmannen arvellaan olevan M. tuberculosis -bakteerin infektoima (latentti tuberkuloosi-infektio, LTBI). Taudin leviämiseen ja kuolleisuuteen johtavia tekijöitä ovat köyhyys, hoidon puute, lisääntyvä lääkeresistenssi, diabetes, huumeiden ja alkoholin käyttö sekä samanaikainen HIV-infektio (2). Yli 90 % uusista tapauksista ja kuolemista esiintyy köyhissä maissa. Kehitysmaissa ilmaantuvuus on noin 200/100 000 henkeä vuosittain. Euroopassa se on vastaavasti 13/100 000 elintason paranemisen sekä rokotusten ja tehokkaan lääkehoidon ansiosta (3).

Suomessa tuberkuloosin ilmaantuvuus väheni 1900- ja 2000-luvuilla. Nykyisin ilmaantuu noin 250 uutta tapausta vuodessa eli vuosittainen ilmaantuvuus on alle 5/100 000 (3-5). Kuten muissakin pienen ilmaantuvuuden maissa, myös Suomessa todetuista keuhkotuberkuloositapauksista noin 10-20 % johtaa potilaan kuolemaan (5). Noin 30 %:ssa todetuista tapauksista kyseessä on keuhkojen ulkopuolinen tuberkuloosi (3).

Korvatuberkuloosi on hyvin harvinainen länsimaissa ainakin kantaväestön keskuudessa. Saksalaistutkimuksen mukaan kaikista korvainfektioista alle 0,1 % johtuu tuberkuloosista (2,6).

Paradoksaaliseksi reaktioksi kutsutaan tilannetta, jossa asianmukaisesta lääkehoidosta huolimatta potilaan yleistila heikkenee ja tuberkuloosi etenee nopeasti (7). Paradoksaalinen reaktio voi ilmentyä uusina vaurioina keuhkoissa, imusolmukkeissa, aivoissa tai muissa elimissä. Nykyisin vain 1,6 %:ssa kaikista tuberkuloositapauksista tautia todetaan maha-suolikanavassa, ja suolen puhkeama on erittäin harvinainen komplikaatio. Japanissa on kuvattu paksusuolen puhkeamaan johtanut paradoksaalinen reaktio (8).

Kuvaamme diagnostisesti vaikean potilastapauksen, jossa tauti levisi poikkeavasti keuhkojen ulkopuolelle ja mahalaukun puhkeaminen johti asianmukaisen hoidon aikana potilaan kuolemaan.

måndag 29 maj 2023

Rokoteborrelioosia vasaan kehiteillä, kertoo Tekniikka&Talous!

 

Ruotsalaiset tutkijat kehittävät parhaillaan maailman ensimmäistä rokotetta borrelioosia vastaan. Nyt rokote on testivaiheessa. Asiasta uutisoi norjalainen tiedeuutissivusto Forskning.no.

Tällä hetkellä 15 000 testihenkilöä saavat jo kolmannen annoksensa uutta rokotetta. Rokotustutkimus kestää vähintään kaksi punkkisesonkia. Sen jälkeen kestää vielä pari vuotta ennen kun rokote hyväksytään ja tulee saataville Eurooppaan.

”Arvioin uuden rokotteen olevan saatavilla vuonna 2026”, sanoo tutkimusta johtava professori Johan Sanmartin Berglund Blekingen teknisen korkeakoulun tiedotteessa.

Tavoitteena on kehittää kaikkialla maailmassa eri punkkilajeihin tehoava rokote. Koska borrelioosia tai lymen tautia aiheuttavia bakteereja on niin monta, on tällaisen rokotteen kehittäminen vaikeaa, kertoo Berglund.

Punkkien eli puutiaisten levittämää borrelioosia ei tule sekoittaa puutiaisaivokuumeeseen, johon rokote on jo olemassa. Vahvistettuja borrelialöydöksiä oli tartuntatautirekisterin mukaan Suomessa 2571 vuonna 2021. Tapaukset ovat lisääntyneet viime vuosien aikana.

Arviolta 20–25 prosenttia puutiaisista kantaa borrelioosibakteeria. Borrelioosin ensioireisiin kuuluu purema-alueelle ilmestyvä ihottuma ja flunssan kaltaiset yleisoireet.

THL:n mukaan hoitamattomana tauti voi johtaa oireisiin ihossa, hermostossa, nivelissä, lihaksissa, sydämessä ja silmissä.

söndag 28 maj 2023

GRAM + bakteerit ovat joko kokkeja, basilleja tai haaroittuneita filamentteja sisältäviä sauvoja, joiden soluseinämä on paksua peptidoglykaania

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK470553/

Gram Positive Bacteria

; ; . Last Update: February 19, 2023.

Continuing Education Activity

Gram-positive organisms have highly variable growth and resistance patterns. The SCOPE project (Surveillance and Control of Pathogens of Epidemiologic Importance) found that in those with an underlying malignancy, gram-positive organisms accounted for 62 percent of all bloodstream infections in 1995 and 76 percent in 2000 while gram-negative organisms accounted for 22 percent in 1995 and 14 percent in 2000. This activity reviews the evaluation and management of gram-positive bacterial infections and explains the role of the interprofessional team in improving care for affected patients.

Objectives:

  • Explain how to evaluate for a gram-positive bacterial infection.
  • Identify common infections caused by gram-positive bacteria.
  • Describe treatment strategies for gram-positive bacterial infections.
  • Outline interprofessional team strategies to improve care coordination and communication to provide quality care to patients with gram-positive bacterial infections.
Access free multiple choice questions on this topic.

Introduction

Health professionals need to understand the important difference between gram-positive and gram-negative bacteria. Gram-positive bacteria are bacteria classified by the color they turn in the staining method. Hans Christian Gram developed the staining method in 1884. The staining method uses crystal violet dye, which is retained by the thick peptidoglycan cell wall found in gram-positive organisms. This reaction gives gram-positive organisms a blue color when viewed under a microscope. Although gram-negative organisms classically have an outer membrane, they have a thinner peptidoglycan layer, which does not hold the blue dye used in the initial dying process. Other information used to differentiate bacteria is the shape. Gram-positive bacteria comprise cocci, bacilli, or branching filaments.

Etiology

Gram-positive cocci include Staphylococcus (catalase-positive), which grows clusters, and Streptococcus (catalase-negative), which grows in chains. The staphylococci further subdivide into coagulase-positive (S. aureus) and coagulase-negative (S. epidermidis and S. saprophyticus) species. Streptococcus bacteria subdivide into Strep. pyogenes (Group A), Strep. agalactiae (Group B), enterococci (Group D), Strep viridans, and Strep pneumonia.

Gram-positive bacilli (rods) subdivide according to their ability to produce spores. Bacillus and Clostridia are spore-forming rods while Listeria and Corynebacterium are not. Spore-forming rods that produce spores can survive in environments for many years. Also, the branching filament rods encompass Nocardia and actinomyces

Gram-positive organisms have a thicker peptidoglycan cell wall compared with gram-negative bacteria. It is a 20 to 80 nm thick polymer while the peptidoglycan layer of the gram-negative cell wall is 2 to 3 nm thick and covered with an outer lipid bilayer membrane.

 

Uuden antibiootin kehittelya: Abausiini ( GmPcide, Gram(+) bacteriecide)

 https://www.forskning.se/2022/11/03/ny-typ-av-antibiotika-effektiv-mot-resistenta-bakterier/

Aamu-uutisissa  helluntaisunnuntaina mainitaan abausiinin kehittely antibioottikäyttöön multiresistenttejä bakteereita kohtaan. Göteborgin yliopiston fys.kem. laitoksella   Aiempaa tietoa Umeån yliopsitosta.

Ny typ av antibiotika effektiv mot resistenta bakterier

Klockan tickar för att få bukt med den växande antibiotikaresistensen som hotar vår hälsa. En ny sorts antibiotika som kan döda svårbekämpade bakterier kan vara en viktig pusselbit i kampen för nya effektiva preparat, visar forskning vid Umeå universitet.

– Det här är starten på en ny klass av antibiotiska substanser som fungerar på väldigt många bakterier som förknippas med vårdrelaterade infektioner, som man även brukar kalla sjukhussjuka, till exempel VRE och MRSA, säger Fredrik Almqvist, professor vid Umeå universitet och som forskat om nya alternativ till antibiotika sedan slutet av 1990-talet.

Fungerande antibiotika är avgörande för att rädda liv inom till exempel kirurgi, cancerbehandling och intensivvård, men också för att behandla vanliga sjukdomar som klamydia eller lunginflammation. Men i takt med att antibiotikaresistensen ökar tickar klockan för forskarvärlden.

– Antibiotikaresistens är listat av WHO som en av planetens största utmaningar. Man pratar om att det är i paritet med klimathotet, säger Fredrik Almqvist.

Ny klass antibiotika

Studier som gjorts vid Umeå universitet och Washington university i Saint Louis, USA, kan vara en viktig pusselbit i kampen mot de farliga bakterierna.

Den nya klassen antibiotika, som forskarna kallar GmPcider, bekämpar så kallade Gram-positiva bakterier. Enligt studierna är de effektiva på egen hand, men förhöjer även effekten när de kombineras med redan existerande antibiotika.

Dödar även bakterier som växer

Forskningen visar att GmPciderna inte bara kan stoppa bakterierna från att försöka sig, utan även döda bakterier som inte är under tillväxt. Något som annan antibiotika ofta har svårt att göra.

Fredrik Almqvist är väldigt hoppfull över resultaten.

– Det här är ett första steg, en ny klass som har spännande egenskaper, och nu jobbar vi såklart vidare för att de här ska gå att utveckla till något som också kan hjälpa människor framöver. Vårt mål är att komma till en substans som bakterierna inte lätt blir resistenta mot, säger han.

Vetenskaplig artikel

Ring-fused 2-pyridones effective against multidrug-resistant Gram-positive pathogens and synergistic with standard-of-care antibiotics. Pnas.

Kontakt:

Fredrik Almqvist, professor vid Kemiska institutionen, Umeå universitet

tisdag 23 maj 2023

Mehiläisissä ja kimalaisissakin voi olla punkkia Miten se haittaa ihmiskuntaa?

 https://www.ruokavirasto.fi/teemat/tuonti-ja-vienti/eu-maat-norja-ja-sveitsi/elaimet/mehilaiset-ja-kimalaiset/

Haitta on ilmeisesti ekonomista tasoa, koska näiden  hyötyhyönteisten medentuotto ja pölytyskapasiteetti  huononevat niiden taudeista.  

SITAATTI ruokaviraston ohjeistuksista:

Mehiläisten (bin) ja kimalaisten (humlor) siirrot EU:n jäsenvaltioiden välillä

HUOM! Tutustuthan huolellisesti eläimien ja niiden sukusolujen EU-sisämarkkinakaupan muihin yleisperiaatteisiin verkkosivuillamme.

Tämä ohje koskee kaikkia niitä toimijoita, jotka siirtävät tässä ohjeessa tarkoitettuja tarhamehiläisiä ja kimalaisia Suomesta EU-maihin, Norjaan tai Sveitsiin ja tuovat niitä Suomeen EU-maista, Norjasta tai Sveitsistä.

Siirrettävien mehiläisten ja kimalaisten mukana voi levitä tarttuvia tauteja. Lisäksi ne voivat levittää kasvitauteja. Tarkistathan ennen tuontia myös kasvitauteihin liittyvät siirtorajoitukset kasvinterveys@ruokavirasto.fi. Koska lainsäädännössä mehiläisille, kimalaisille ja pakkausmateriaalille vaaditaan vain silmämääräinen tarkastus, on olemassa riski, että mehiläisten mukana siirtyy esikotelomätäbakteereja. Tuoja voi halutessaan pyytää alkuperätarhasta todistuksen esimerkiksi hunaja- tai sikiökakkunäytteiden tutkimisesta esikotelomädän varalta. Ruokavirasto suosittelee kaiken pakkausmateriaalin polttamista, kun mehiläiset on purettu. Kuningattarien mukana tulevat seuralaismehiläiset tulisi myös hävittää.

1. Eläintaudeista voi aiheutua siirtorajoituksia

Seuraavista eläintautiepidemioista voi aiheutua lajikohtaisia rajoituksia lähtömaissa ja niiden alueilla:

Esikotelomätä (American foulbrood, Paenibacillus larvae): mehiläiset

Pieni pesäkuoriainen (Small hive beetle, Aethina tumida): mehiläiset ja kimalaiset

Tropilaelaps punkki (Tropilaelaps mite, Tropilaelaps sp.): mehiläiset

Varroa -punkki (Varroa mite, Varroa spp.): mehiläiset

Tarkista aina ennen jokaista siirtoa ajankohtaiset siirtorajoitukset tältä Maa- ja metsätalousministeriön sivustolta.

2. Terveystarkastus ja eläinterveystodistus

Lähetys on tarkastettava ennen siirtoa. Tarkastuksen tekee lähtömaan virkaeläinlääkäri viejän pyynnöstä. Eläinlajikohtaisissa eläinterveysvaatimuksissa on eritelty tarkemmin, milloin ja mitä tarkastuksia eläinlääkärin tulee tehdä.

Tarkastuksen tehnyt eläinlääkäri myöntää siirrettävälle erälle eläinterveystodistuksen sähköisessä TRACES-järjestelmässä. Terveystodistus on voimassa 10 päivää myöntämishetkestä ja sen täytyy olla eläinlähetyksen mukana koko matkan ajan.

Eläinterveystodistuksessa on oltava vähintään seuraavat tiedot:

  • Lähettäjän ja vastaanottajan nimi ja osoite
  • Lähettävän ja vastaanottava pitopaikan nimi, osoite ja hyväksyntä- tai rekisterinumero
  • Eläinlaji- ja luokka sekä vaadittaessa tunnistetiedot
  • Tiedot eläinten terveystilanteesta ja lisätakeet seuraavista:
    • alkuperäjäsenvaltio tai -vyöhyke
    • eläinten alkuperäinen pitopaikka ja alkuperäparvi, mukaan lukien testitulokset soveltuvin osin
    • lähetettävät eläimet, mukaan lukien testitulokset
  • Myöntämispäivä, -aika, -paikka ja voimassaoloaika, virkaeläinlääkärin nimi, virka-asema, allekirjoitus ja toimivaltaisen viranomaisen leima

Asiasta säädetään komission delegoidun asetuksen (EU) 2020/688 71 artiklassa ja liitteessä I.

3. Eläinterveysvaatimukset

3.1 Mehiläiset

Mehiläisten alkuperätarhan on oltava rekisteröity pitopaikka ja sen on sijaittava sellaisen alueen keskellä, jota:

  1. kolmen kilometrin säteellä ympäröivällä alueella ei ole raportoitu esikotelomätää lähtöä edeltävien 30 päivän aikana ja jossa ei sovelleta siitä johtuvia rajoituksia.
  2. 100 kilometrin säteellä ympäröivällä alueella ei ole raportoitu pienen pesäkuoriaisen esiintymistä, ja jossa ei sovelleta siitä johtuvia rajoituksia. Tästä kohdasta voidaan poiketa, kun siirretään pelkkiä mehiläiskuningattaria, katso lisää kohdassa 3.1.1.
  3. 100 kilometrin säteellä ympäröivällä alueella ei ole raportoitu Tropilaelaps-punkin esiintymistä, ja jossa ei ole voimassa siitä johtuvia rajoituksia.
  4. Varroa spp. -punkista vapaille alueille siirrettävien mehiläisten on tultava Varroa spp. punkista vapaasta jäsenvaltiosta tai vyöhykkeeltä. Lisäksi mehiläiset on suojattava varroa -punkilta kuljetuksen aikana.

Siirrettävissä mehiläisissä, niiden alkuperäpesissä, pakkauksissa ja muissa materiaaleissa ei saa esiintyä merkkejä esikotelomädästä, Tropilaelaps-punkista tai pienestä pesäkuoriaisesta.

Lähettäjämaan virkaeläinlääkärin täytyy tehdä lähetyksen tunnistustarkastus ja silmämääräinen tarkastus siirtoa edeltävien 48 tunnin aikana esikotelomädän, pienen pesäkuoriaisen ja Tropilaelaps-punkin havaitsemiseksi.

Asiasta säädetään komission delegoidun asetuksen (EU) 2020/68 48, 50 ja 91 artikloissa.

3.1.1 Mehiläiskuningattaria koskeva poikkeus

Mehiläiskuningattaria voidaan siirtää sellaiselta tarhalta, joka sijaitsee vähintään 30 kilometrin etäisyydellä pienen pesäkuoriaisen esiintymisen vuoksi perustetun suojavyöhykkeen (säteeltään vähintään 20 km) rajasta. Tämä edellyttää, että yllä olevat mehiläisten siirtovaatimukset täyttyvät, ja:

  • alkuperätarha sijaitsee alueella, jolla suoritetaan vuosittaista viranomaisvalvontaa pienen pesäkuoriaisen esiintymisen havaitsemiseksi. Lisäksi tarhassa on tehty tuotantokaudella kuukausittaiset viranomaistarkastukset, joissa pientä pesäkuoriaista ei ole havaittu, ja
  • mehiläiset on pakattu yksittäishäkkeihin, joissa niillä on kullakin enintään 20 seuramehiläistä.

Tätä poikkeusta soveltaessa virkaeläinlääkärin täytyy tehdä lähetyksen tunnistustarkastus ja silmämääräinen tarkastus siirtoa edeltävien 24 tunnin aikana. Samalla on tarkastettava pitopaikan kirjanpidosta, ettei kuukausittaisessa valvonnassa ole todettu pientä pesäkuoriaista, ja ettei seuramehiläisten lukumäärä ylity. Virkaeläinlääkärin täytyy myös valvoa, että koko lähetys tai kuljetushäkit peitetään heti tarkastuksen jälkeen tiheäsilmäisellä verkolla (silmäkoko enintään 2 mm).

Asiasta säädetään komission delegoidun asetuksen (EU) 2020/688 5, 49 ja 91 artikloissa.

3.2 Kimalaiset

Siirrettävien kimalaisten tulee täyttää seuraavat vaatimukset:

  1. Niissä ei saa esiintyä merkkejä pienestä pesäkuoriaisesta.
  2. Ne ovat peräisin rekisteröidystä pitopaikasta, jota 100 km säteellä ympäröivällä alueella ei ole raportoitu pienen pesäkuoriaisen esiintymistä.

Lähettävän maan virkaeläinlääkärin täytyy tehdä aikaisintaan 48 tuntia ennen siirtoa kimalaislähetykselle tunnistustarkastus ja silmämääräinen tarkastus pienen pesäkuoriaisen havaitsemiseksi.

Asiasta säädetään komission delegoidun asetuksen (EU) 48 ja 91 artikloissa.

3.2.1 Poikkeus, joka koskee kimalaisten siirtoa ympäristöstään eristetyistä kimalaisten tuotantolaitoksista toisiin jäsenvaltioihin

Toimijat saavat siirtää kimalaisia ympäristöstään eristetyistä kimalaisten tuotantolaitoksista toisiin jäsenvaltioihin, jos kimalaisissa ei esiinny merkkejä pienen pesäkuoriaisen esiintymisestä, JA

  1. ne on kasvatettu eristettyinä erillisissä epidemiologisissa yksiköissä siten, että kukin yhdyskunta on suljetussa kuljetuspäällyksessä, joka oli ennen käyttöä uusi tai puhdistettu ja desinfioitu
  2. epidemiologisen yksikön säännöllisissä tutkimuksissa, jotka tehdään vakioitujen kirjallisten toimintaohjeiden mukaisesti, ei ole havaittu pienen pesäkuoriaisen (Aethina tumida) esiintymistä kyseisessä epidemiologisessa yksikössä.

lördag 20 maj 2023

Viimeksi GITHUB sivulle tullut linja Kiinasta on XBB.1.9.1 alalinja

 XBB.1.9.1  alias FL

XBB.1.9.1 sublineage with S:D215V (A22206T) rapidly increases in China (57 seqs) #2001
 Defining mutations: XBB.1.9.1>C3511T>A22206T(S:D215V)
GISAID query: Spike_D215V, C3511T, C11956T
Earliest seq: 2023-04-25 (Sichuan Province, China, EPI_ISL_17637501)
Most recent seq: 2023-05-08 (Hubei Province, China, EPI_ISL_17671943)
Countries detected: China (57, Hubei Province 27, Sichuan Province 21, Shanghai Municipality 6, Gansu Province 1, Henan Province 1, Heilongjiang Province 1)

Kiinassa dominantti linja XBB.1.9.1 ilmentää alalinjoja monissa maissa

 Esim tämä:

This is the 1st XBB.1.9.1 sub-lineage with the convergent S:F456L.
From sars-cov-2-variants/lineage-proposals#27

Sub-lineage of: XBB.1.9.1
Mutations on top of XBB.1.9.1: C28846T, G2174A(orf1a:E637K), T22928C(S:456L)
GISAID query: C28846T, G2174A, T22928C

No. of seqs: 27 (3 USA,  4 China,  7 Vietnam,   1 Singapore(from Vietnam),  2 France,  2 Canada,  3 South Korea (1 from Vietnam),  5 Japan)

Note that all 3 green Vietnamese seqs have S:456 dropout, they're likely to also have 456L.
GISAID query for the green Vietnamese seqs: C28846T, G2174A, G1464T,-T22928C,C12890T

First seq: 17481621, 2023-3-9, Vietnam
Latest seq: 17641519, 2023-5-1 ,Canada


Eräs nopeahkosti kasvava FY.3 alalinja Kiinassa

 FY= XBB.1.22.1

 Sub-lineage of:XBB.1.22.1.3 with ORF1ab: E3764G (A11556G) = NSP6_E195G
Earliest sequence:2023-03-31
Most recent sequence:2023-05-11
Countries circulating:China(,Hubei 65, Henan 3,Sichuan 2,Shanghai 1, Anhui 1)
GISAID Search: G2513A,C23191T,A11556G

XBB linjavariantteja ilmenee monista maista. Esimerkki GITHUB lähtestä

 FP koodi tarkoittaa XBB.1.4.1 linjaa.

Sublineage of: FP.1
Earliest sequence: 2023/04/05 (Singapore)
Most recent sequence: 2023/05/03 (Singapore)
Countries circulating: Singapore, 16 local cases and 2 cases with recent travel history from Malaysia (could be local as well)

Mutations on top of FP.1: T27134C > A28858C (N:R195S) > C9487T, A27917T (ORF8:8C)

A27917T changes the ORF8:8 stop codon (TGA) to a Cysteine (TGT), thus functionally restores the truncated ORF8. It'll be interesting to monitor if this restoration of ORF8 will confer any growth (dis)advantage over stock FP.1.

GISAID query: del21767, A27917T, A28858C

 FP.1 has 69/70del

 

 

fredag 19 maj 2023

WHO:n arvio 18.5. 2023 seuraavasta Covid-19 rokotteen kokoomuksesta

 

Statement on the antigen composition of COVID-19 vaccines

18 May 2023
Statement
Reading time: 6 min (1616 words)

The WHO Technical Advisory Group on COVID-19 Vaccine Composition (TAG-CO-VAC) continues to meet regularly to assess the implications of SARS-CoV-2 evolution for COVID-19 vaccine antigen composition and advise WHO on whether changes are needed to the antigen composition of future COVID-19 vaccines.

In April 2023, the TAG-CO-VAC indicated that the advisory group would convene at least twice in 2023: once in May 2023 and again, approximately 6 months later. At each meeting, recommendations to either maintain current vaccine composition or to consider updates will be issued. This frequency of evidence review by the TAG-CO-VAC is based on the kinetics of vaccine-derived immunity and the need for continued monitoring of the evolution of SARS-CoV-2, and will be adjusted if and as necessary. The TAG-CO-VAC met on 11-12 May 2023 to review the genetic and antigenic evolution of SARS-CoV-2, the performance of currently approved vaccines against circulating SARS-CoV-2 variants and the implications for COVID-19 vaccine antigen composition.

As previously stated by the TAG-CO-VAC, the objective of an update to COVID-19 vaccine antigen composition is to enhance vaccine-induced immune responses to circulating SARS-CoV-2 variants. This statement and the recommendation for change is intended for all vaccine manufacturers and is intended to inform future formulations of COVID-19 vaccines.

The TAG-CO-VAC recognizes and reiterates that currently approved COVID-19 vaccines, including those based on the index virus, continue to provide substantial protection against severe disease and death, which is the primary objective for COVID-19 vaccination. Currently approved COVID-19 vaccines should continue to be used in accordance with the current WHO SAGE Roadmap, published in April 2023. Notwithstanding the protection against severe disease, protection against symptomatic disease is limited and less durable. New formulations of COVID-19 vaccines are needed to improve protection against symptomatic disease.

Evidence reviewed

The published and unpublished evidence reviewed by the TAG-CO-VAC included: (1) SARS-CoV-2 evolution, including genetic and antigenic characteristics of earlier and current SARS-CoV-2 variants, including XBB.1 descendent lineages, and its impact on cross-neutralization and cross-protection following vaccination and/or infection; (2) Vaccine effectiveness (VE) of currently approved vaccines during periods of XBB.1 descendant lineage circulation; (3) Antigenic cartography analyzing antigenic relationships of SARS-CoV-2 variants using naïve animal sera and human sera following vaccination and/or infection; (4) Preliminary preclinical data on immune responses in animal models, following infection with XBB.1 descendent lineages; (5) Preliminary preclinical immunogenicity data on the performance of candidate vaccines with updated antigens (data not shown); and (6) B cell memory responses following vaccination and/or infection.

Further details on the publicly available data reviewed by the TAG-CO-VAC can be found in the accompanying data annex. Unpublished and/or confidential data are not shown.

The TAG-CO-VAC acknowledges the limitations of the available data:

  • While the trajectory of further SARS-CoV-2 evolution indicates that XBB will likely be the progenitor of SARS-CoV-2 variants in the near term, the timing, specific mutations and antigenic characteristics, and the potential public health risks of future variants remain unknown;
  • Data on cross-reactivity (breadth) of immune responses elicited by currently circulating SARS-CoV-2 variants are limited. The majority of the available clinical and preclinical data are on the recent variants XBB.1 or XBB.1.5, but there is minimal information on other current variants of interest or variants under monitoring;
  • Data on immune responses over time following infection with currently circulating SARS-CoV-2 variants are limited;
  • Though neutralizing antibodies titers have been shown to be important in protection from SARS-CoV-2 infection and in estimates of vaccine effectiveness, there are multiple layers of immune protection elicited by infection and/or vaccination. Data on the immune response specific for XBB.1 descendent lineages are largely restricted to neutralizing antibodies and are limited for other aspects of the immune response, including cellular immunity;
  • Data on the protection conferred by hybrid immunity (i.e. combination of infection- and vaccination-induced immunity) are largely derived from populations that predominantly received an mRNA booster dose;
  • Data on VE of current COVID-19 vaccines, including index-virus based and bivalent mRNA vaccines, against XBB descendent lineages are limited and estimates during periods of XBB.1 descendant lineage circulation are only available for mRNA vaccines; 
  • Data on candidate vaccines that include an XBB.1 descendent lineage are limited to animal models.

A summary of available evidence and the recommendations that follow were discussed by the TAG-CO-VAC and provided to WHO.

Summary of available evidence

  • In the fourth year of the pandemic, there is high seroprevalence in the global population as a result of vaccination and/or infection, and immunological profiles against SARS-CoV-2 are highly heterogeneous (i.e. individuals have been infected with different variants and/or vaccinated using a variety of vaccine platforms).
  • There continues to be substantial genetic and antigenic evolution of the spike protein of SARS-CoV-2, and the evolutionary trajectory continues to diverge from the index virus. Despite increasing gaps in genomic surveillance globally, the available sequencing data indicates that the index virus and other early variants (e.g., Alpha, Beta, Gamma and Delta) are no longer detected in humans.
  • As of May 2023, the XBB.1 descendent lineages currently predominate globally (i.e., XBB.1.5, XBB.1.16, XBB.1.9).
  • As described in the WHO Technical Advisory Group on SARS-CoV-2 Virus Evolution XBB.1.5 Updated Risk Assessment and the XBB.1.16 Initial Risk Assessment, XBB descendent lineages, including XBB.1.5 and XBB.1.16, are highly immune evasive, with XBB.1.5 being one of the SARS-CoV-2 variants with the greatest magnitude of immune escape from neutralizing antibodies to date.
  • Estimates of VE against currently circulating SARS-CoV-2 variants, including XBB.1 descendent lineages, are very limited in terms of the number of studies, vaccine products evaluated, and populations assessed; some studies show similar VE against BA.5 descendent and XBB.1 descendent lineages, while others suggest reduced VE during periods of predominance of XBB.1 descendent lineages.
  • Sera from individuals who have received two, three or four doses of index virus-based vaccines, or a booster dose of a bivalent (BA.1- or BA.4/5- containing) mRNA vaccine show substantially lower neutralizing antibody titers against XBB.1 descendent lineages, as compared to titers specific for the antigens included in the vaccine. Individuals with hybrid immunity due to any SARS-CoV-2 infection show higher neutralizing antibody titers against XBB.1 descendent lineages as compared to responses from vaccinated individuals who had no evidence of infection.
  • There is in vitro evidence that immune imprinting, which is a phenomenon in which B cell memory recall responses towards previously encountered antigen reduce the response to new antigens, may be occurring. However, based on observational epidemiological studies to date, the clinical impact remains unclear.
  • Preclinical data shared confidentially with the TAG-CO-VAC by vaccine manufacturers show that vaccination with XBB.1 descendent lineage-containing candidate vaccines (including XBB.1.5) elicits higher neutralizing antibody responses to currently circulating SARS-CoV-2 variants, compared to responses elicited by currently approved vaccines.

Recommendations for updates to COVID-19 vaccine antigen composition

There is ongoing and considerable genetic and antigenic evolution of SARS-CoV-2, high seroprevalence and heterogeneous population immunity to SARS-CoV-2. As current WHO SAGE policy specifies, vaccination programmes should continue to complete the primary series and booster dose(s) for high priority and medium priority groups. Furthermore, the WHO Global COVID-19 Vaccination Strategy, published in July 2022, also calls for vaccines with improved durability and breadth of protection.

Updates to vaccine antigen composition may enhance vaccine-induced immune responses to circulating SARS-CoV-2 variants, consistent with the previous statement by the TAG-CO-VAC published in June 2022.

As of May 2023, XBB.1 descendent lineages predominate SARS-CoV-2 circulation globally. In order to improve protection, in particular against symptomatic disease, new formulations of COVID-19 vaccines should aim to induce antibody responses that neutralize XBB descendent lineages. One approach recommended by TAG-CO-VAC is the use of a monovalent XBB.1 descendent lineage, such as XBB.1.5 (e.g., hCoV-19/USA/RI-CDC-2-6647173/2022, GenBank: OQ054680.1, GISAID: EPI_ISL_16134259 or WHO Biohub: 2023-WHO-LS-01, GenBank: OQ983940, GISAID EPI_ISL_16760602) as the vaccine antigen. Given the small genetic and antigenic differences from XBB.1.5, XBB.1.16 (e.g., hCoV-19/USA/MI-CDC-LC1038976/2023, GenBank: OQ931660 GISAID: EPI_ISL_17619088) may be an alternative. The spike antigens of both of these lineages are genetically and antigenically very closely related, with only two amino acid differences between XBB.1.5 and XBB.1.16 (E180V and T478R).  Other formulations and/or platforms that achieve robust neutralizing antibody responses against XBB descendent lineages can be considered.

While currently approved COVID-19 vaccines, including those based on the index virus, continue to provide protection against severe disease, the TAG-CO-VAC advises moving away from the inclusion of the index virus in future formulations of COVID-19 vaccines. This is based on the following reasons: the index virus and antigenically closely related variants no longer circulate in humans; the index virus antigen elicits undetectable or very low levels of neutralizing antibodies against currently circulating SARS-CoV-2 variants, including XBB descendent lineages; inclusion of the index virus in bi- or multivalent vaccines reduces the concentration of the new target antigen(s) as compared to monovalent vaccines, which may decrease the magnitude of the humoral immune response; and immune imprinting due to repeated exposure to the index virus may reduce immune responses to new target antigen(s).

Further data requirements and considerations

Given the limitations of the evidence upon which the recommendations above are derived and that the evolution of the virus is expected to continue, the TAG-CO-VAC strongly encourages the generation of data on immune responses and clinical endpoints in humans who receive a COVID-19 vaccine with an updated composition, across different vaccine platforms, as well as further data on the performance of current COVID-19 vaccines against circulating SARS-CoV-2 variants. Additionally, the TAG-CO-VAC continues to encourage the further development of vaccines that enhance mucosal immunity because they may improve protection against infection and reduce transmission of SARS-CoV-2, in alignment with the WHO Global COVID-19 Vaccination Strategy, published in July 2022. Finally, it is imperative for multilateral organizations, governments and manufacturers to continue collaborating towards access to currently approved COVID-19 vaccines and to ensure equitable global access for vaccine(s) with an updated antigen composition as they become available.

CDC info Diseases transmitted by ticks 2023

 Punkkien välittämiä tauteja CDC.gov  tieto  englanninkielellä

 http://www.cdc.gov/ticks/diseases/index.html

Diseases Transmitted by Ticks

Print

In the United States, some ticks carry pathogens that can cause human disease, including:

  • Anaplasmosis is transmitted to humans by tick bites primarily from the blacklegged tick (Ixodes scapularis) in the northeastern and upper midwestern U.S. and the western blacklegged tick (Ixodes pacificus) along the Pacific coast.
  • Babesiosis is caused by microscopic parasites that infect red blood cells. Most human cases of babesiosis in the U.S. are caused by Babesia microti. Babesia microti is transmitted by the blacklegged tick (Ixodes scapularis) and is found primarily in the northeast and upper midwest.
  • Borrelia mayonii infection has recently been described as a cause of illness in the upper midwestern United States. It has been found in blacklegged ticks (Ixodes scapularis) in Minnesota and Wisconsin. Borrelia mayonii is a new species and is the only species besides B. burgdorferi known to cause Lyme disease in North America.
  • Borrelia miyamotoi infection has recently been described as a cause of illness in the U.S. It is transmitted by the blacklegged tick (Ixodes scapularis) and has a range similar to that of Lyme disease.
  • Bourbon virus infection has been identified in a limited number patients in the Midwest and southern United States. At this time, we do not know if the virus might be found in other areas of the United States.
  • Colorado tick fever is caused by a virus transmitted by the Rocky Mountain wood tick (Dermacentor andersoni). It occurs in the the Rocky Mountain states at elevations of 4,000 to 10,500 feet.
  • Ehrlichiosis is transmitted to humans by the lone star tick (Ambylomma americanum), found primarily in the southcentral and eastern U.S.
  • Heartland virus cases have been identified in the Midwestern and southern United States. Studies suggest that Lone Star ticks can transmit the virus. It is unknown if the virus may be found in other areas of the U.S.
  • Lyme disease is transmitted by the blacklegged tick (Ixodes scapularis) in the northeastern U.S. and upper midwestern U.S. and the western blacklegged tick (Ixodes pacificus) along the Pacific coast.
  • Powassan disease is transmitted by the blacklegged tick (Ixodes scapularis) and the groundhog tick (Ixodes cookei). Cases have been reported primarily from northeastern states and the Great Lakes region.
  • Rickettsia parkeri rickettsiosis is transmitted to humans by the Gulf Coast tick (Amblyomma maculatum).
  • Rocky Mountain spotted fever (RMSF) is transmitted by the American dog tick (Dermacentor variabilis), Rocky Mountain wood tick (Dermacentor andersoni), and the brown dog tick (Rhipicephalus sangunineus) in the U.S. The brown dog tick and other tick species are associated with RMSF in Central and South America.
  • STARI (Southern tick-associated rash illness) is transmitted via bites from the lone star tick (Ambylomma americanum), found in the southeastern and eastern U.S.
  • Tickborne relapsing fever (TBRF) is transmitted to humans through the bite of infected soft ticks. TBRF has been reported in 15 states: Arizona, California, Colorado, Idaho, Kansas, Montana, Nevada, New Mexico, Ohio, Oklahoma, Oregon, Texas, Utah, Washington, and Wyoming and is associated with sleeping in rustic cabins and vacation homes.
  • Tularemia is transmitted to humans by the dog tick (Dermacentor variabilis), the wood tick (Dermacentor andersoni), and the lone star tick (Amblyomma americanum). Tularemia occurs throughout the U.S.
  • 364D rickettsiosis (Rickettsia phillipi, proposed) is transmitted to humans by the Pacific Coast tick (Dermacentor occidentalis ticks). This is a new disease that has been found in California.

Punkkivälitteiseistä infektioista ollut verkkoseminaari marraskuussa 2022 Ruotsissa

 Webb-seminaarin luennoitsijat Ruotsin Yliopistosita  Löydän  seminaarin mainoksesta heidän nimensä:

(Yleiskatsaus:

Övergripande om fästingar,klimat, epidemiologi etc.  Per -Eric Lindgren,professori

Borrelia, svensk studie om biopsi av EM.Samuewl Crohnjurt, doktorand,Johan Berglund, professor. 

Neoehrlicia för allmänläkare. Lisa Labbe sandelin,doktoran, Christine Wennerås, professor. 

Babesia-en blodparasit som ofta flyger under den diagnostiska radarn. Matilda Lövmar, doktorand, Kristina Persson , universitetslektor) .

 Netistä löytyy  jaettavissa oleva   artikkeli  samalla otsikolla  Fästingburna infektioner ja se on tutkimustyö Linköpingin Yliopistosta, mutta en löydä tässä  tutkijan nimeä

 https://liu.se/forskning?areas=&areas=&term=&searchId=%7B27478D9D-89BD-4582-8119-919347C2513F%7D&filter_templates_sm=&filter_=_71df9eba52864b71b568e28e354b5b3c:f54d298f666349818da09581a6348c94:&take=3&sort=asc&view=grid&expanded=true

SITAATTI netistä: 

"Fästingburna infektioner

- Vilka fästingburna infektioner förekommer i Sverige och i våra grannländer
och är de symtomgivande?
- Hur presenterar sig infektionerna kliniskt och vilken
diagnostik bör tillämpas?
- Hur samspelar immunförsvaret med fästingburna
mikrober och vilken är prognosen vid respektive fästingburen sjukdom?"

Stor fästing hållen av Johanna Sjöwall, BKV."Flera fästingburna mikrober är känt humanpatogena; 

såsom 
Borrelia (B.) burgdorferi sensu lato,
 B. miyamotoi,
Anaplasma (A.) phagocytophilum, 
Rickettsia (R.) helvetica, 
Tick-borne Encephalitis virus (TBEV), 
 Neoerlichia Micurensis (NM),
 Francisella tularensis och 
Babesia arter. 

Ett flertal nya arter är misstänkt humanpatogena, vilket indikerar att omfattningen av fästingburna infektioner sannolikt kommer att öka i framtiden."

"Risken för att bli infekterad och få symtom efter ett fästingbett är ofullständigt studerad. Endast grova uppskattningar av prevalens har gjorts baserat på förekomst av patogenförekomst i fästingar i olika naturområden. Enstaka studier har kartlagt serologisk respons och symtomutveckling på kort sikt i anslutning till fästingbett. Däremot har varken det immunologiska svaret, kliniska förloppet på kort och lång sikt eller prognos av sjukdom hos den fästingbitna personen tidigare studerats i relation till patogenförekomst i fästingen. Därav är det okänt hur ofta fästingar, som bitit människa, är infekterade med patogener och med vilka arter och subtyper samt hur fästingburen patogen och immunförsvaret samspelar i huden och i kroppens övriga organ."

"Dessutom är det okänt varför infektionsförloppet vid olika fästingburna sjukdomar, men främst beträffande TBE och borrelios, skiljer sig hos olika individer. En del av mina forskningsprojekt i samarbete med namngivna kollegor nedan avser att sammanställa kliniska och immunologiska data över patienter med verifierad neuroborrelios i Sydöstra sjukvårdsregionen samt TBE och Borrelios på Åland samt patienter med olika kliniska manifestationer av Borrelios i Sverige, med särskilt intresse för artrit. Jag avser även att tillsammans med öronläkare sammanställa kliniska data över patienter med diagnosticerad akut hörselnedsättning och studera huruvida det finns koppling till fästingburen infektion. Därutöver är jag tillsammans med medarbetare intresserad av att studera hur arterna B. valaisiana, B. miyamotoi, NM, R. Helvetica och Babesia presenterar sig kliniskt och immunologiskt i Norden."

"Fästingburna mikrober i huden

Immunreaktivitet i huden efter fästingbett har tidigare studerats vid manifest infektion och då främst hos patienter med erythema migrans (EM); det patognomona hudutslaget som uppstår till följd av en borreliainfektion. Flertalet studier har visat förekomst av fästingburna bakterier i den infekterade huden och en karakteristisk immunaktivering lokalt. Vår forskargrupp har tidigare publicerat en studie, i vilken det lokala immunsvaret i huden i anslutning till EM studerades i relation till patienter med olika kliniska förlopp efter antibiotikabehandling. En ny studie pågår nu på Åland, i vilken fokus ligger på det tidiga immunförsvaret i huden i direkt anslutning till fästingbettet och betydelsen av kvaliteten på immunsvaret i relation till det kliniska förloppet hos den fästingbitna personen. Vi följer patienterna under flera månaders tid, både med frågeformulär, blodprover och hudbiopsier."

"Vår forskargrupp har under de senaste 10 åren ansvarat för den s.k. STING-studien, i vilken vi samlat in fästingar som bitit människa och kartlagt risken för fästingburen infektion efter fästingbett. Vi har byggt upp en gedigen biobank med mer än 10 000 fästingar, blodprover vid två tillfällen under studietiden från mer än 5000 fästingbitna individer och enkäter med kliniska data från deltagande personer. Samarbetet har genom åren utökats till ett nordiskt dito, med nodansvariga forskare i Oslo, Kristiansand, Köpenhamn och Åland, Finland. Dessutom har vi initierat ett gemensamt forskningsprojekt med Dr Joppe Hovius i Amsterdam, Nederländerna (främst B. miyamotoi). Vi har publicerat data på förekomst av Lyme borrelios och TBE samt även Rickettsios, Anaplasmos och infektion med NM. Uppkomst av infektion orsakad av Babesia och B. valaisiana efter fästingbett är några ytterligare intresseområden inom STING-studien."

"Fästingburna mikrober i centrala nervsystemet

Vi har pågående studier, som avser kartlägga förekomst av de nya fästingburna patogenerna (Rickettsiae, NM, Anaplasma, Babesia, B. Miyamotoi, Francisella Tularensis) i centrala nervsystemet hos patienter som söker vård på misstanke om fästingburen hjärnhinneinflammation."

"Fästingburna mikrober i ledvätska

Lyme artrit är ett av flera kroniska symtom som kan uppkomma vid obehandlad Borreliainfektion. Tillståndet är vanligt i USA, där endast en subtyp av Borrelia förekommer (B. burgdorferi sensu stricto). Denna subtyp är artritogen, dvs är benägen att orsaka artrit, men kan även ge upphov till samtliga Borreliamanifestationer. Tillståndet är mycket väl beskrivet i USA, men okänd till incidens, förekomst av Borrelia subtyp samt immunologisk och klinisk presentation i Europa och Sverige. Avsikten är att inleda en multicenterstudie, för att undersöka prevalens av Lyme artrit i Sverige och att beskriva handläggning, det kliniska förloppet, analysera orsakande Borrelia subtyp och ev förekomst av co-infektion samt att erhålla kunskap om kronisk antibiotikarefraktär artrit ur ett epidemiologiskt, mikrobiologiskt, immunologiskt och kliniskt perspektiv."

"Övergripande mål

Det övergripande syftet med studierna är att utveckla och optimera metoder och kunskap för att bättre kunna förebygga, handlägga och prediktera risken för fästingburen infektion och om möjligt använda kunskapen för att minska ökningen och spridningen av sjukdomsalstrande fästingar och de infektioner de orsakar. Ovanstående mål uppfylls genom utvecklandet av:
1) molekylärbiologiska metoder för detektion och kvantifiering av patogener i fästingen och
2) serologiska metoder för indirekt analys av exponerade asymtomatiska och symtomatiska individer och genom att
3) behandla och studera det kliniska förloppet hos fästingbitna personer med symtom och
4) sprida erhållen kunskap till sjukvården och allmänheten.
Vi har under de senaste 10 åren byggt upp en stor biobank, som möjliggör translationell forskning under lång tid."

Miten klamydia asetetaan taxonomisesti? LINKKI

 

Chlamydia

Taxonomy ID: 810 (for references in articles please use NCBI:txid810)
current name
Chlamydia Jones et al. 1945 (Approved Lists 1980) emend. Sachse et al. 2015
homotypic synonym:
"Prowazekia" Coles 1953, effective name 1)
Chlamydia Jones et al. 1945 (Approved Lists 1980) emend. Everett et al. 1999
NCBI BLAST name: chlamydias
Rank: genus
Genetic code: Translation table 11 (Bacterial, Archaeal and Plant Plastid)
Other names:
heterotypic synonym
"Miyagawanella" Brumpt 1938, effective name 1)
heterotypic synonym
"Rickettsiaformis" Zhdanov and Korenblit 1950, effective name 1)
heterotypic synonym
"Bedsonia" Meyer 1953, effective name 1)
heterotypic synonym
"Rakeia" Levaditi et al. 1964, effective name 1)
heterotypic synonym
Chlamydophila Everett et al. 1999
Lineage( full )
cellular organisms; Bacteria; PVC group; Chlamydiota; Chlamydiia; Chlamydiales; Chlamydiaceae; Chlamydia/Chlamydophila group
 
 
 
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=cgencodes#SG11
The Genetic code linkki. 
 
 
 
 
 
 
 
 

MYCOPLASMATOTA , ennen: Tenericutes (Tener Cutis = soft skin)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=2092&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock 

Lineage (full): cellular organisms; Bacteria; Terrabacteria group; Mycoplasmatota; Mollicutes; MycoplasmatalesMycoplasmataceae     Click on organism name to get more information.

 Tästä löytää Mykoplasmat, Spiroplasmat, Ureoplasmat

tisdag 16 maj 2023

BABESIOOSI on zoonoosi ja punkin välittämä tauti. Se voi myös aiheuttaa ihmiselle sairautta.

 *OIE lähteestä tietoa tästä zoonoosista.

 https://www.woah.org/app/uploads/2022/02/babesiosis-new-or-unusual-occurrences.pdf

Babesiosis is a tick-borne disease of various wildlife (such as lions, deer, primates, rhinos, etc.) caused by protozoan parasites of the genus Babesia . Babesiosis affects a wide range of domestic and wild animals, and occasionally humans. Species of Babesia vary in their infectivity. Species of Babesia relevant to wildlife include: B. bovis , B. leo, B. cati, B. felis , B. divergens , B. majo r, B. ovata , B. occultans , B. orientalis, B. mer i, and B. jakimovi.

* Ruotsin lääkärilehti mainitsee babesioosista että se voi olla luultua  tavallisempi Ruotsissa.

Babesia-infektion kan vara vanligare i Sverige än vi tidigare trott Parasiten kan spridas via fästingar och blodtransfusion


Viides Kansainvälinen Rikketsiain ja rikketsioositautien konferenssi Marseillessa toukokuussa 2008

 DOI:https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2009.03128.x

The fifth International Conference for Rickettsiae and Rickettsial Diseases was held in Marseilles, France, on 18–20 May 2008, organized by the European Study Group for Coxiella, Anaplasma, Rickettsia and Bartonella (ESCAR) and by the American Society for Rickettsiology. Much of the Conference was devoted to original scientific work and this supplement contains those papers presented at the meeting.
The rickettsias and the bacteria formerly associated with the order Rickettsiales, namely, the genus Coxiella, are of major importance for the study of obligate intracellular microorganisms and their potential use as biological weapons. In addition, studies on some members of the genus Bartonella, also formerly placed in the Order Rickettsiales, are increasingly recognized as important human pathogens. Although the clinical and epidemiologic spectra of rickettsioses have been studied for years, new observations and discoveries are still being made, as exemplified by many of the papers in this supplement. Particularly noteworthy in the area of basic science is the increased appreciation of the obligate intracellular rickettsia's interaction with the eukaryote host cells.
The scientific range of papers presented at the meeting and contained within this supplement is wide. As a result, we have particularly enjoyed editing the supplement, as the opportunity to do so has provided us with an in-depth opportunity to reflect on the important contributions of our colleagues. We are grateful to all the contributors for their work, which so vividly shows the new advances that can occur in what many might consider an established field, unlikely to offer new horizons.
 Lineage (full): cellular organisms; BacteriaPseudomonadota     Click on organism name to get more information.

RICKETTSIALES   löytyy alfaproteobakteerien  listan loppupuolelta aakkosluettelosta.

RICKETTSIEAE*   Rickettsia  

Apuna listan löytämisen on alleviivattu sana*

Otan siitä kohtaa  sitaatin. jossa  alimmaisen  bakteerin jälkeen on monen sivun luettelo erilaisia  rikketsioita eri puolilta maailmaa ja erilaisista vektoreistakin. Oikein rikketsioiden maailmankartta!

Lineage (full): cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Rickettsiales; Rickettsiaceae Rickettsieae     Click on organism name to get more information.

JATKUU MONTA SIVUA!

måndag 15 maj 2023

PUNKIT ja erilaiset kuumeet Esimerkkejä (Relapsing Fever Agents) . RF- ryhmä punkkikuumeita

(15.5. 2023 Siirsin nämä borreliakuumeet  virusblogista tähän  INFEKTIOISTA-blogiin, jotta TBE-osuus punkin välittämästä  tautiryväksedstä  jää erikseen hahmotettavaksi. Punkkien axonomialinkkejä pidän ELÄKEPÄIVÄT- blogin sivulla, josta niitä voi helposti hakea.  Punkit vaikuttavat aikamoisilta  tekijöiltä taudinvälittäjäkapasiteetiltaan).

Your search for relapsing fever agens retrieved no results
Tick-borne diseases and co-infection: Current considerations.
Cutler SJ, Vayssier-Taussat M, Estrada-Peña A, Potkonjak A, Mihalca AD, Zeller H. Ticks Tick Borne Dis. 2021 Jan;12(1):101607. doi: 10.1016/j.ttbdis.2020.101607. Epub 2020 Nov 9. PMID: 33220628 Review.
Given this, it is unsurprising that these might co-exist within the same tick, however our understanding of the interactions of these agents both within the tick and vertebrate host remains poorly defined. ...
Tickborne Diseases: Diagnosis and Management.
Pace EJ, O'Reilly M. Am Fam Physician. 2020 May 1;101(9):530-540. PMID: 32352736 Free article. Review.
Tickborne diseases that affect patients in the United States include Lyme disease, Rocky Mountain spotted fever (RMSF), ehrlichiosis, anaplasmosis, babesiosis, tularemia, Colorado tick fever, and tickborne relapsing fever. ...
CD55 Facilitates Immune Evasion by Borrelia crocidurae, an Agent of Relapsing Fever.
Arora G, Lynn GE, Tang X, Rosen CE, Hoornstra D, Sajid A, Hovius JW, Palm NW, Ring AM, Fikrig E. mBio. 2022 Oct 26;13(5):e0116122. doi: 10.1128/mbio.01161-22. Epub 2022 Aug 29. PMID: 36036625 Free PMC article.
To investigate the pathoetiology of relapsing fever, we performed a high-throughput screen of Borrelia-binding host factors using a library of human extracellular and secretory proteins and identified CD55 as a novel host binding partner of Borrelia crocidurae and B …
Seven-versus 14-day course of antibiotics for the treatment of bloodstream infections by Enterobacterales: a randomized, controlled trial.
Molina J, Montero-Mateos E, Praena-Segovia J, León-Jiménez E, Natera C, López-Cortés LE, Valiente L, Rosso-Fernández CM, Herrero M, Aller-García AI, Cano Á, Gutiérrez-Gutiérrez B, Márquez-Gómez I, Álvarez-Marín R, Infante C, Roca C, Valiente-Méndez A, Pachón J, Reguera JM, Corzo-Delgado JE, Torre-Cisneros J, Rodríguez-Baño J, Cisneros JM; SHORTEN trial team. Clin Microbiol Infect. 2022 Apr;28(4):550-557. doi: 10.1016/j.cmi.2021.09.001. Epub 2021 Sep 9. PMID: 34508886 Clinical Trial.
Clinical outcomes included clinical cure, relapse of eBSI and relapse of fever. A superiority margin of 3 days was set for the primary endpoint, and a non-inferiority margin of 10% was set for clinical outcomes. ...CONCLUSIONS: 7-day schemes allowed a reduction in antibiot …
Tick-borne relapsing fever.
Aviles ES, Oakes M, Algranati M, Mansoor AM. BMJ Case Rep. 2020 Jul 16;13(7):e237296. doi: 10.1136/bcr-2020-237296. PMID: 32675137 Free PMC article. No abstract available.
Common Skin Rashes in Children.
Allmon A, Deane K, Martin KL. Am Fam Physician. 2015 Aug 1;92(3):211-6. PMID: 26280141 Free article.
Considerations include the appearance and location of the rash; the clinical course; and associated symptoms, such as pruritus or fever. A fever is likely to occur with roseola, erythema infectiosum (fifth disease), and scarlet fever. ...The rash associated w …
Borreliae Part 2: Borrelia Relapsing Fever Group and Unclassified Borrelia.
Trevisan G, Cinco M, Trevisini S, di Meo N, Ruscio M, Forgione P, Bonin S. Biology (Basel). 2021 Oct 29;10(11):1117. doi: 10.3390/biology10111117. PMID: 34827110 Free PMC article. Review.
Borreliae of the relapsing fever group (RFG) are heterogenous and can be divided mainly into three groups according to vectors, namely the soft-tick-borne relapsing fever (STBRF) Borreliae, the hard-tick-borne relapsing fever (HTBRF) Borr …
Relapsing fever causative agent in Southern Iran is a closely related species to East African borreliae.
Naddaf SR, Ghazinezhad B, Kazemirad E, Cutler SJ. Ticks Tick Borne Dis. 2017 Oct;8(6):882-886. doi: 10.1016/j.ttbdis.2017.07.006. Epub 2017 Jul 17. PMID: 28736193
We obtained two blood samples from relapsing fever patients residing in Jask County, Hormozgan Province, southern Iran in 2013. ...In southern Iran, relapsing fever cases are mostly from localities in which O. erraticus ticks, the notorious vector of B …
Louse-borne relapsing fever (Borrelia recurrentis infection).
Warrell DA. Epidemiol Infect. 2019 Jan;147:e106. doi: 10.1017/S0950268819000116. PMID: 30869050 Free PMC article. Review.
Louse-borne relapsing fever (LBRF) is an epidemic disease with a fascinating history from Hippocrates' times, through the 6th century 'Yellow Plague', to epidemics in Ireland, Scotland and England in the 19th century and two large Afro-Middle Eastern pandemics in th …
Relapsing Fever Borreliae: A Global Review.
Cutler SJ. Clin Lab Med. 2015 Dec;35(4):847-65. doi: 10.1016/j.cll.2015.07.001. Epub 2015 Aug 22. PMID: 26593261 Review.
Relapsing fever borreliae were notorious and feared infectious agents that earned their place in history through their devastating impact as causes of both epidemic and endemic infection. ...