Select item 2935459917.Legionellan funktioiden paljastamiseen tarvittavasta työvälinelaatikosta: Dot/Icm tyyppi IVb sekreetiojärjestelmän vaikuttajat . Nykyinen tilanne ja tulevaiset suuntaukset.
The Toolbox for Uncovering the Functions of Legionella Dot/Icm Type IVb Secretion System Effectors: Current State and Future Directions. Schroeder GN. Front Cell Infect Microbiol. 2018 Jan 5;7:528. doi: 10.3389/fcimb.2017.00528. eCollection 2017. Review. PMID: 29354599 Free PMC Article Similar articles
Dot/Icm tyyppi IV:n sekreetiojärjestelmä T4SS on legionella lajeille essentielli virulenssitekijä sen intrasellulaarisessa elämässä ja ptogeenisuudessa.
Dot on lyhennys sanoista defektiivinen organellien kuljetuksessa
ja Icm tulee sanoista intrasellulaarinen monistuminen.
tämä bakteeri sitten käyttää IV-tyyppistä eritysjärjestelmää, josta tulee lyhennys T4SS.
Tämä Dot/Icm- modulia sijaitsee bakteerin pooleissa ja kun se on invasoitumassa soluun ja joutuu kosketuksiin solun kanssa, näistä vapauttu effektoreita sytosoliin valmsitamaan lopulta bakteerille turvallisen vakuolin LCV, legionellaa sisältävän vakuolin.
Seulontatutkimukset ovat osoittaneet, että yksittäinen L-pneumophila-kanta käyttää Dot/Icm T4SS järjestelmäänsä translokoimaan ennenkuulumattoman määrän effektoreita, yli 300 proteiinia , isäntäsoluun. Siellä ne ovat nimeltään IDTS: icm/Dot- translokoituneita substraatteja, effektoreita, jotka manipuloivat isäntäsolun funktioita bakteerin eduksi. Pan-genus genomin bioinformatiikan analyyseistä arvellaan että oletettuja effektoreita on olemassa vähintäin 608 ortologista ryhmää. Näiden effektoreiden funktion koodin ratkaiseminen on avain Legionellan patogeneesin ymmärtämiseen. Mutta analyysi on haastavaa. Runsaan funktionaalisen ylenpalttisuuden takia yksittäisen geenideleetiomutantin klassinen, fenotyyppinen seulonta on enimmäkseen tehotonta. Tässä artikkelissa tutkija raportoi kokeellisista lähestymistavoista, joilla on onnistuttu menestyksellä tunnistamaan, arvioimaan ja luonnehtimaan T4SS- effektoreita ja valaisemaan uusia metodeita, jotka lupaavasti nopeuttavat Legionellan erinomaisen asearsenaalin salaisuuksien paljastamista
Abstract
The
defective in organelle trafficking/intracellular multiplication
(Dot/Icm) Type IVb secretion system (T4SS) is the essential virulence
factor for the intracellular life style and pathogenicity of Legionella species. Screens demonstrated that an individual L. pneumophila
strain can use the Dot/Icm T4SS to translocate an unprecedented number
of more than 300 proteins into host cells, where these, so called
Icm/Dot-translocated substrates (IDTS) or effectors, manipulate host
cell functions to the benefit of the bacteria. Bioinformatic analysis of
the pan-genus genome predicts at least 608 orthologous groups of
putative effectors. Deciphering the function of these effectors is key
to understanding Legionella pathogenesis; however, the analysis
is challenging. Substantial functional redundancy renders classical,
phenotypic screening of single gene deletion mutants mostly ineffective.
Here, I review experimental approaches that were successfully used to
identify, validate and functionally characterize T4SS effectors and
highlight new methods, which promise to facilitate unlocking the secrets
of Legionella's extraordinary weapons arsenal. KEYWORDS:
Dot/Icm; Legionella; Type IVb secretion system; effectors; functional genomics; host targets; infection models; toolbox PMID: 29354599 PMCID: PMC5760550 DOI: 10.3389/fcimb.2017.00528
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar